More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1732 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  874    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  56.01 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 
472 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.15 
 
 
463 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  51.47 
 
 
458 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 
457 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.25 
 
 
463 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  54.16 
 
 
446 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  51.35 
 
 
445 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  50.23 
 
 
446 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  49.89 
 
 
446 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 
448 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 
442 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  46.73 
 
 
442 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
448 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
449 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
444 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
448 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  33.18 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  29.17 
 
 
457 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  30.67 
 
 
471 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  37.12 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
465 aa  166  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  38.1 
 
 
465 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  37.68 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  41.64 
 
 
381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
442 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  28.45 
 
 
457 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  29.81 
 
 
452 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
445 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  35.71 
 
 
449 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  39.93 
 
 
480 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  36.58 
 
 
458 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  36.39 
 
 
449 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
449 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  36.03 
 
 
456 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
458 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
458 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
454 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
449 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  27.79 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
455 aa  156  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
459 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
469 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
435 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  34.23 
 
 
458 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
455 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  34.53 
 
 
455 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  34.53 
 
 
455 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
389 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  36.23 
 
 
429 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.61 
 
 
446 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.57 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
455 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  29.87 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
459 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  35.35 
 
 
453 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
466 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
439 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
446 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  31.91 
 
 
472 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
440 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.59 
 
 
453 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
433 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
446 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
420 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  34.36 
 
 
416 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
446 aa  136  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  36.39 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  32.36 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
563 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  35.21 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.11 
 
 
461 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  29.3 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.65 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  32.28 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.42 
 
 
455 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.76 
 
 
461 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
443 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.76 
 
 
461 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  29.53 
 
 
450 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.74 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
501 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  32.08 
 
 
360 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
454 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.4 
 
 
1162 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
574 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.01 
 
 
512 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>