More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1392 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  933    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  99.56 
 
 		 455 aa  929    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  37.88 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33.7 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  33.41 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 454 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.12 
 
 		 458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  36.98 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 458 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 459 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  32.24 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  41.33 
 
 		 381 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  31.8 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 467 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.38 
 
 		 471 aa  202  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.65 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.65 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  37.62 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  37.2 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  36.7 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  36.01 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  34.67 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  36.25 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  28.97 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  33.68 
 
 		 461 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  28.82 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  34.46 
 
 		 457 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 429 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  29.65 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  29.74 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  29.11 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  35.53 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 536 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  35.74 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  27.27 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 440 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  28.81 
 
 		 464 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 471 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  36.13 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  35.81 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 570 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.24 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 362 aa  163  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  27.84 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 536 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  26.87 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  31.56 
 
 		 458 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  26.49 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  31.56 
 
 		 458 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  31.56 
 
 		 458 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  32.28 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 535 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  31.84 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  32.68 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  31.84 
 
 		 456 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  30.28 
 
 		 469 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>