More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3770 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.38 
 
 		 458 aa  804    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.05 
 
 		 454 aa  811    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.52 
 
 		 449 aa  769    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  95.1 
 
 		 449 aa  847    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70 
 
 		 455 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.89 
 
 		 449 aa  911    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 449 aa  919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  96.66 
 
 		 449 aa  892    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  87.72 
 
 		 458 aa  820    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.72 
 
 		 458 aa  819    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.56 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  66.44 
 
 		 458 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.38 
 
 		 466 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.04 
 
 		 455 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  60.59 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  59.38 
 
 		 453 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  33.41 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  33.33 
 
 		 468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  33.11 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  33.7 
 
 		 462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  34.21 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  39.08 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  38.65 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  38.65 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  38.65 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  39.35 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  38.87 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  37.9 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  37.9 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  37.9 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  37.9 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  37.9 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  38.17 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  33.05 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  39.08 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  37.9 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  37.9 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  32.54 
 
 		 472 aa  212  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  38.87 
 
 		 456 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  35.91 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  38.17 
 
 		 457 aa  206  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  37.14 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 421 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  30.64 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.36 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.15 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  37.5 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.32 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.36 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 469 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  30.55 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.29 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  36.49 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  33.04 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 450 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  30.66 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  32.88 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.52 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 448 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  35.66 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  30.08 
 
 		 482 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  27.79 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  31.37 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  29.38 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.53 
 
 		 365 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>