More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06762 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  79.65 
 
 
457 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  100 
 
 
457 aa  935    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  56.76 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
457 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  35.71 
 
 
471 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  35.71 
 
 
468 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
459 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
455 aa  182  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
455 aa  182  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  30.63 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  36.36 
 
 
480 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
389 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.12 
 
 
465 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.6 
 
 
453 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  34.55 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
449 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  34.22 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
445 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
446 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
467 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
455 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  32.01 
 
 
428 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  34.01 
 
 
456 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
435 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  30.89 
 
 
428 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
445 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
446 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  32.73 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
458 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
449 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
471 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
449 aa  153  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
463 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  30.41 
 
 
462 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
416 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
454 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
448 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  30.21 
 
 
458 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  30.45 
 
 
465 aa  150  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  29.72 
 
 
458 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  32.25 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.65 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  29.38 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
419 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
446 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  32.49 
 
 
468 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  32.12 
 
 
464 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
459 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30 
 
 
472 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  32.38 
 
 
365 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  30.51 
 
 
446 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
429 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
421 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
463 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
457 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
423 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
449 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
455 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.46 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  28.97 
 
 
453 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  33.1 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
466 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
428 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  31.48 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
449 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  33.44 
 
 
445 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  24.28 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  28.7 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  29.93 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
430 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  31.25 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  31.27 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  29.25 
 
 
538 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
536 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
439 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
469 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  31.64 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>