More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1920 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  100 
 
 
445 aa  874    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  98.2 
 
 
445 aa  858    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  70.43 
 
 
446 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  68.56 
 
 
446 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.11 
 
 
446 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.11 
 
 
446 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  66.67 
 
 
450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  66.36 
 
 
449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.43 
 
 
446 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.2 
 
 
446 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.36 
 
 
443 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
459 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
445 aa  192  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  37.62 
 
 
449 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
450 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  37.62 
 
 
449 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
449 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
421 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
442 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  31.07 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.07 
 
 
472 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
465 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
419 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.71 
 
 
412 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.85 
 
 
456 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  31.22 
 
 
416 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  37.37 
 
 
480 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
469 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  38.08 
 
 
465 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
454 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  29.12 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
449 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  32.07 
 
 
452 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
381 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
440 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
455 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  27.9 
 
 
455 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
458 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
454 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
449 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
458 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  33.44 
 
 
457 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  34.92 
 
 
429 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  31.23 
 
 
458 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  31.23 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
449 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
449 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
429 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.33 
 
 
453 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  31.56 
 
 
458 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  28.42 
 
 
462 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
458 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
463 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
472 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  35.69 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  32.6 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.33 
 
 
471 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.74 
 
 
365 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
455 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
445 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  35.58 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  34.15 
 
 
471 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  31.11 
 
 
449 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
525 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
493 aa  136  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  35.82 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  32.41 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  34.9 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
426 aa  133  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
433 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  38.81 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
570 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
362 aa  130  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
448 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  33.91 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  38.22 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33.88 
 
 
566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  37.98 
 
 
446 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  36.8 
 
 
445 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>