More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3963 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  100 
 
 		 446 aa  872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  79.33 
 
 		 442 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.78 
 
 		 448 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.33 
 
 		 442 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  94.84 
 
 		 446 aa  815    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.53 
 
 		 448 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  54.05 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.47 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.58 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  51.69 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  54.83 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.24 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  54.23 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  26.1 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  34.4 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  37.88 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  31.25 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  36.54 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  38.77 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  31.95 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  31.95 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  36.79 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  34.94 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  34.87 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  37.98 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  29.38 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  37.98 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  30.53 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  32.09 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  30.09 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  33.1 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  27.76 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.21 
 
 		 1162 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  28.49 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  32.32 
 
 		 456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.73 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  31.53 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.17 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.17 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  28.49 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 536 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 488 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.42 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.47 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  25.82 
 
 		 617 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  25.82 
 
 		 617 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  35.71 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  25.82 
 
 		 617 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  28.99 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  34.66 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>