More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  98.2 
 
 		 445 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  100 
 
 		 445 aa  873    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  70.72 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.34 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.11 
 
 		 446 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  67.65 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  66.67 
 
 		 450 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.74 
 
 		 446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  65.91 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.97 
 
 		 446 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.68 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  37.29 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  37.29 
 
 		 449 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.25 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  30.99 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.39 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.79 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  35.59 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  37.37 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  29.21 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 381 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  32.49 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  31.78 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  31.55 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  34.92 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  33.44 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  32.19 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.65 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  36.04 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  27.43 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.53 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 457 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  31.97 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.59 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 455 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.74 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  34.15 
 
 		 471 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  36.19 
 
 		 438 aa  136  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  35.9 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 513 aa  134  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 570 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  32.41 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  35.35 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  33.22 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 543 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  32.32 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  37.98 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  35.87 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  38.61 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  37.17 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  37.12 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>