More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2573 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.53 
 
 		 419 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 421 aa  842    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.8 
 
 		 420 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  57.55 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  45.5 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 445 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  39.61 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  46.42 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  35.57 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  34.63 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  34.42 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 442 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  40.61 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  42.91 
 
 		 480 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  34.41 
 
 		 456 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  41.3 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 389 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  31.79 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  39.73 
 
 		 465 aa  176  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  31.35 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  30.09 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  30.53 
 
 		 458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 469 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 440 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  36.18 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  30.04 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  35.84 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 458 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  29.36 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  31.49 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.26 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 455 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  28.57 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  37.87 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  34.36 
 
 		 462 aa  156  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  37.13 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  30.43 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  37.09 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  32.66 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 457 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  37.09 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  35.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  35.04 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  32.58 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  34.59 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  29.68 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  34.59 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  34.59 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  36.03 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  30.82 
 
 		 471 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 467 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  34.19 
 
 		 457 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  30.17 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  33.94 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  33.94 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  33.94 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  33.94 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>