More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3381 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
473 aa  953    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 
717 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  34.85 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
485 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
444 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
451 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
453 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
443 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
442 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
443 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
330 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  37.42 
 
 
425 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
472 aa  206  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  37.42 
 
 
425 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
456 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.64 
 
 
396 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
494 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
488 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
391 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
463 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
493 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
469 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
488 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  32.39 
 
 
458 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  30.57 
 
 
474 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  37.95 
 
 
458 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
488 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  32.67 
 
 
440 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
435 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
440 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  41.02 
 
 
276 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
441 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  37.17 
 
 
425 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
440 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
440 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  37.2 
 
 
444 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  34.82 
 
 
469 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
442 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
440 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
440 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
488 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  40.21 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
428 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  35.49 
 
 
344 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
428 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  38.33 
 
 
454 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  41.26 
 
 
270 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  35.54 
 
 
344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  35.97 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
359 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  31.84 
 
 
432 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
468 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
442 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
425 aa  179  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
443 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  35.87 
 
 
479 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
493 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
428 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
349 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
450 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  34.11 
 
 
434 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
484 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
434 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
435 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
462 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
435 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
438 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
473 aa  171  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
480 aa  170  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
484 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
484 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
479 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
436 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
444 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
462 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  32.79 
 
 
499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>