More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2234 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
442 aa  870    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
463 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  38.24 
 
 
444 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
442 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
473 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
444 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
493 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
469 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
472 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  38.59 
 
 
467 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
454 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  30.5 
 
 
425 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
425 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
444 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
438 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
446 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
717 aa  176  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  38.81 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0653725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
468 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  45.42 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  36.74 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
435 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
462 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
485 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.16 
 
 
396 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
443 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
462 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
494 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  37.92 
 
 
276 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
488 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
442 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  38.91 
 
 
440 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
462 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  39.23 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  31.72 
 
 
458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  33.96 
 
 
499 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
428 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
460 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  39.31 
 
 
435 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  39.19 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  40.22 
 
 
454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
535 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
435 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
359 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
447 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
451 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  38.13 
 
 
432 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
453 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
439 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
441 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  38.13 
 
 
416 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
440 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
468 aa  159  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  40.21 
 
 
442 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  33.77 
 
 
474 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  34.07 
 
 
479 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
493 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
451 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
434 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
464 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
330 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
428 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
428 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
442 aa  156  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
440 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
454 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
472 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  36.22 
 
 
440 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
480 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  38.2 
 
 
440 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
440 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  37.05 
 
 
448 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  36 
 
 
446 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
469 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  39.27 
 
 
270 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  31.32 
 
 
432 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
437 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
488 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
469 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
488 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
488 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
441 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
455 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  37.99 
 
 
439 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>