More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4653 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
446 aa  890    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  56.41 
 
 
467 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.08 
 
 
444 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 
442 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  46.49 
 
 
454 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
453 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
497 aa  272  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  45.64 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  44.74 
 
 
491 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  40.72 
 
 
458 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
453 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
485 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  34.3 
 
 
440 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
443 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
472 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
454 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  39.86 
 
 
276 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  41.47 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
451 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.79 
 
 
499 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  38.13 
 
 
425 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  27.42 
 
 
425 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  27.42 
 
 
425 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
493 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
464 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
535 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
434 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  37.14 
 
 
444 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
441 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
435 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
443 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
443 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
453 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  30.09 
 
 
435 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
463 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
330 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.28 
 
 
344 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
430 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  30.79 
 
 
443 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
437 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
717 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
442 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  38.64 
 
 
438 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
349 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3730  histidine kinase  37.95 
 
 
458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  35.89 
 
 
344 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
480 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
488 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.94 
 
 
469 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  32.2 
 
 
440 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  33.25 
 
 
432 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
440 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
440 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
440 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  35.64 
 
 
458 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  37.05 
 
 
448 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
451 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.82 
 
 
396 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
479 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
359 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  37.61 
 
 
270 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.18 
 
 
474 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  37.16 
 
 
473 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  32.81 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
419 aa  163  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
488 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
488 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
428 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  38.65 
 
 
358 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
455 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
428 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  31.18 
 
 
434 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
455 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  36.78 
 
 
482 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
476 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
440 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  38.06 
 
 
442 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
440 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
436 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
455 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
428 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
428 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
456 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
442 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
435 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
493 aa  156  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
469 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  29.1 
 
 
479 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
484 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
439 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  37.7 
 
 
450 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>