More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2618 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 436 aa  864    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  36.06 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  37.23 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  36.98 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 485 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  40.45 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.24 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  36.02 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 494 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  29.53 
 
 		 425 aa  170  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 469 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  35.44 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 476 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 488 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  33.64 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 493 aa  163  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 440 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 451 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  37.16 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  37.81 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.74 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  37.83 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.74 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  40.38 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  40.15 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 456 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.66 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  37.25 
 
 		 270 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 717 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  38.72 
 
 		 276 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 344 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 477 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0653725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  37.59 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 535 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04427  two-component system sensor protein  40.28 
 
 		 219 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  33.44 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 458 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 469 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  34.12 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  32.85 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 462 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  33.68 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>