More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04427 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04427  two-component system sensor protein  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  78.97 
 
 		 499 aa  335  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 494 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 		 444 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 443 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 493 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  44.39 
 
 		 276 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 443 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 451 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  42.52 
 
 		 425 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  42.52 
 
 		 425 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 464 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 476 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  40.28 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 469 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 454 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 443 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  44.59 
 
 		 444 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  42.33 
 
 		 358 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 437 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  43.06 
 
 		 454 aa  154  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 453 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 469 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 488 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 488 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  41.12 
 
 		 391 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 472 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  41.41 
 
 		 479 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 453 aa  151  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 436 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 717 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 453 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.19 
 
 		 396 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 446 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  39.25 
 
 		 474 aa  148  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 485 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  37.85 
 
 		 425 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 463 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 455 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 457 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 349 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  40.47 
 
 		 467 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 535 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 480 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 428 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 455 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  40.91 
 
 		 473 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  40.91 
 
 		 482 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.85 
 
 		 344 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 455 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 428 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  39.53 
 
 		 432 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  37.85 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  36.62 
 
 		 438 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  39.35 
 
 		 443 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 473 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 430 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 435 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 444 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  37.85 
 
 		 435 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 479 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 434 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 462 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 479 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 442 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  40.76 
 
 		 458 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  37.21 
 
 		 434 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 497 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 460 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 474 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 469 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 462 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 359 aa  134  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 462 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 442 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  40.19 
 
 		 486 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 484 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 428 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 468 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 484 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  41.33 
 
 		 472 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 484 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 456 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 428 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  39.71 
 
 		 491 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 432 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 483 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 466 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 484 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  40.55 
 
 		 458 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 468 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 438 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 462 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 441 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  36.11 
 
 		 440 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 477 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 475 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 468 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>