More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4352 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
450 aa  897    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.68 
 
 
438 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
468 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
462 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
466 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 
477 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 
462 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 
462 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 
456 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
460 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
462 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
469 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
462 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 
474 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  43.31 
 
 
468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  43.31 
 
 
468 aa  356  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  42.37 
 
 
472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
453 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
447 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  40.91 
 
 
458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  41.24 
 
 
432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
458 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  39.41 
 
 
446 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  41.95 
 
 
440 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.91 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
468 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
439 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
441 aa  286  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
439 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  38.86 
 
 
439 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
467 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  36.88 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
435 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
445 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  31.07 
 
 
440 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
440 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
440 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
440 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
440 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
717 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
440 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  41.52 
 
 
391 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  40.59 
 
 
276 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
442 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
473 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  39.05 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
441 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
488 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
488 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
453 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  38.46 
 
 
443 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  40.78 
 
 
344 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
435 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
441 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
434 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
472 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  30.37 
 
 
458 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  33.26 
 
 
432 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  39 
 
 
435 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
349 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
443 aa  166  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  40 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  35.67 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
428 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  35.56 
 
 
469 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  36.17 
 
 
499 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  37.32 
 
 
474 aa  163  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
454 aa  163  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  38.76 
 
 
438 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
454 aa  162  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
443 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
494 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  37.33 
 
 
442 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
428 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
493 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  36.52 
 
 
425 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
453 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  36.52 
 
 
425 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
443 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
480 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  35.87 
 
 
440 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
428 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  39.35 
 
 
473 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
439 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
451 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
488 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
469 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  38.69 
 
 
444 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  37.14 
 
 
458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.02 
 
 
396 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
469 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>