More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2145 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
469 aa  954    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.81 
 
 
447 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  72.22 
 
 
432 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.54 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  71.63 
 
 
416 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  64.48 
 
 
458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.03 
 
 
458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  65.46 
 
 
446 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  63.86 
 
 
440 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.57 
 
 
464 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.22 
 
 
472 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  59.87 
 
 
468 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  59.87 
 
 
468 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.42 
 
 
462 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  57.69 
 
 
462 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.04 
 
 
462 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  60.22 
 
 
472 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.41 
 
 
474 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.57 
 
 
462 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.45 
 
 
453 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.11 
 
 
462 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  59.38 
 
 
466 aa  528  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.68 
 
 
477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.28 
 
 
456 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.76 
 
 
460 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 
468 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
450 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
438 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
468 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
439 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  39.5 
 
 
439 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  38.6 
 
 
439 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
442 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.92 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
441 aa  176  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
717 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
494 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  34.81 
 
 
425 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  28.14 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  37.32 
 
 
276 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
444 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
535 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  28.19 
 
 
458 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
458 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  26.98 
 
 
440 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
441 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
442 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  34.08 
 
 
432 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
453 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
473 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
469 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
443 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  34.88 
 
 
435 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
485 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
440 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
440 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  36.05 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
349 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  28.12 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
443 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
469 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
443 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
461 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
442 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
469 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
493 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
433 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
440 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
440 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
330 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  32.41 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  32.3 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
475 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
446 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  36.57 
 
 
444 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
440 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  33.81 
 
 
473 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  35.25 
 
 
270 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.04 
 
 
442 aa  146  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
344 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  36.76 
 
 
442 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
456 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
444 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
464 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  33.81 
 
 
482 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>