More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1836 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
439 aa  863    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  99.54 
 
 
439 aa  860    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.47 
 
 
439 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  56.85 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.28 
 
 
435 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.51 
 
 
442 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
462 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
474 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
464 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
453 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  41.63 
 
 
472 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
468 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
462 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
462 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
462 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
466 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
456 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  39.3 
 
 
468 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  39.3 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
477 aa  285  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
469 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
460 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
447 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  38.34 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  37.53 
 
 
446 aa  267  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
472 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
458 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  37.39 
 
 
458 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
468 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  38.13 
 
 
416 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  37.41 
 
 
440 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
441 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
469 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
472 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.58 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
717 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
493 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
443 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  38.49 
 
 
444 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  31.44 
 
 
430 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  38.04 
 
 
276 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  40.33 
 
 
442 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  36.69 
 
 
425 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.03 
 
 
454 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
444 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
440 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  32.05 
 
 
440 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
440 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  37.74 
 
 
443 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  41.63 
 
 
471 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  28.6 
 
 
425 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  28.6 
 
 
425 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.94 
 
 
469 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  40.19 
 
 
270 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
473 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  38.13 
 
 
435 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
437 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
442 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
440 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
446 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  36.17 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
488 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
453 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.95 
 
 
396 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
463 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
469 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  35.69 
 
 
344 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
349 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
488 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
488 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
454 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
546 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
441 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  30.02 
 
 
437 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  32.67 
 
 
458 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
464 aa  143  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  36.4 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  36.4 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  36.4 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  28.76 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  36.4 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  36.4 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>