More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2268 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  951    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  54.09 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.78 
 
 
462 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.04 
 
 
462 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.39 
 
 
462 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  52.5 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 
477 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  52.98 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.97 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 
456 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.14 
 
 
453 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
460 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  50.69 
 
 
468 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
472 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  50.69 
 
 
468 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
450 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 
464 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  49.89 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  51.14 
 
 
432 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 
447 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 
458 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
438 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.34 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  48.3 
 
 
446 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  48.09 
 
 
440 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  49.41 
 
 
416 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
468 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
441 aa  297  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
439 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  41.53 
 
 
439 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
439 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  41.37 
 
 
439 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
445 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
467 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
442 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
435 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
717 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  41.07 
 
 
276 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
443 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  40.73 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
535 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
473 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  37.37 
 
 
344 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.23 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  36.97 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  36.97 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  36.04 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  36.73 
 
 
432 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
442 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
493 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  30.5 
 
 
440 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.74 
 
 
396 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
434 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
443 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
435 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
330 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
469 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
441 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
349 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
440 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.86 
 
 
469 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
440 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
494 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
440 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  29.8 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
454 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  37.28 
 
 
442 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  33.8 
 
 
359 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  36.49 
 
 
440 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  37.05 
 
 
448 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
480 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.76 
 
 
499 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  40.15 
 
 
471 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
428 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  37.1 
 
 
437 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
464 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
456 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  37.99 
 
 
439 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
472 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  37.99 
 
 
439 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
441 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
451 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
451 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
461 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
439 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
428 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  36.98 
 
 
443 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>