More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2085 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 434 aa  883    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  95.15 
 
 		 435 aa  842    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.74 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.45 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.98 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.74 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  65.05 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  59.76 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  57.71 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.48 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.48 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.64 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.2 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.18 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.41 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.42 
 
 		 451 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.21 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  56.98 
 
 		 440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  53.05 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  49.88 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  49.05 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  39.28 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 443 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.48 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  43.07 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  43.07 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 717 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  43.18 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  38.77 
 
 		 344 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 349 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  41.11 
 
 		 276 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  40.57 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  39.57 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.67 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  33.1 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  39.93 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  37.9 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 535 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001060  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  40.07 
 
 		 479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 455 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 493 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  31.28 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 469 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  35.28 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 462 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 462 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6493  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.25 
 
 		 499 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  34.99 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  36.21 
 
 		 486 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5740  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  36.6 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  38.18 
 
 		 270 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>