More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3288 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 467 aa  918    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.79 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  42.19 
 
 		 472 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  39.51 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  39.51 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 466 aa  299  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 462 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  40.18 
 
 		 432 aa  289  7e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 456 aa  282  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  40.28 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  36.3 
 
 		 458 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  36.81 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  34.81 
 
 		 440 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  33.7 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  32.75 
 
 		 439 aa  190  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 488 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 488 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 717 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  36.12 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  31.45 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  32.45 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  31.5 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.13 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  40.44 
 
 		 276 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  31.5 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  28.66 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 441 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  26.95 
 
 		 444 aa  153  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  30.62 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  29.91 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  37.14 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  27.37 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  27.65 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  33.92 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.55 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  35.37 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  26.29 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  27.37 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 428 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  35.03 
 
 		 450 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  30.99 
 
 		 435 aa  146  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 484 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  35.03 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  35.03 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 444 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  35.03 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>