More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4851 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  80.09 
 
 
462 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  934    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  82.86 
 
 
466 aa  760    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.72 
 
 
462 aa  860    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  87.66 
 
 
462 aa  798    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.29 
 
 
462 aa  879    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.9 
 
 
477 aa  753    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.59 
 
 
460 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.72 
 
 
474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  68.04 
 
 
472 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  64.81 
 
 
468 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  64.81 
 
 
468 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.51 
 
 
472 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.85 
 
 
464 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.97 
 
 
453 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.93 
 
 
456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.21 
 
 
472 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.57 
 
 
469 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.44 
 
 
458 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  61.48 
 
 
432 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.02 
 
 
447 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  58.7 
 
 
440 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  58.51 
 
 
458 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  56.84 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  60.72 
 
 
416 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.07 
 
 
468 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
438 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 
450 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
468 aa  326  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
439 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  40.27 
 
 
439 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
467 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
441 aa  286  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  38.96 
 
 
439 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
435 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
445 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
717 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  42.29 
 
 
391 aa  187  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
349 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
330 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.86 
 
 
396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
488 aa  183  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
488 aa  183  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
480 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
434 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  40.66 
 
 
276 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
435 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
494 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  36.3 
 
 
425 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
443 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
485 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
441 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
473 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  38.29 
 
 
344 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
472 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
493 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
451 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  30.39 
 
 
458 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
535 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
441 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.17 
 
 
344 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  37.22 
 
 
450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  37.22 
 
 
450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  37.01 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  37.45 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  38.17 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  28.77 
 
 
440 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  37.91 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  36.46 
 
 
483 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
440 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  36.47 
 
 
450 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  39.41 
 
 
447 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  39.41 
 
 
447 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  39.41 
 
 
447 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  39.41 
 
 
447 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  39.41 
 
 
447 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
469 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  35.82 
 
 
461 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
488 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
442 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
469 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  36.82 
 
 
452 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  36.73 
 
 
444 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  39.26 
 
 
450 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  39.26 
 
 
450 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  35.13 
 
 
440 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  39.26 
 
 
450 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  39.26 
 
 
450 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>