More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3619 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  826    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 463 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  38.17 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  38.17 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  38.89 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  38.77 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  44.02 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  39.02 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  39.52 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.54 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  38.54 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.57 
 
 		 499 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 493 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  39.84 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  41.01 
 
 		 270 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.93 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  39.33 
 
 		 358 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 454 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 717 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  30.45 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  39.08 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  35.31 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  36.22 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.69 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  36.52 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  36.33 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  38.67 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  37.67 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 439 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 469 aa  136  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  34.93 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  34.41 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  32.17 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 440 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  32.66 
 
 		 436 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  32.09 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  33.96 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  31.76 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  39.17 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04427  two-component system sensor protein  43.35 
 
 		 219 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  31.63 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 488 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 442 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  39.17 
 
 		 491 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  33.96 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0937198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>