More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3232 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  67.09 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.92 
 
 		 493 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  57.58 
 
 		 425 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 488 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 488 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 451 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 485 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  42.67 
 
 		 469 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.14 
 
 		 454 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 453 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 464 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 456 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 472 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 		 480 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 443 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 444 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 717 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 443 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 535 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 494 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  45 
 
 		 391 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  40.76 
 
 		 454 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 453 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 442 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 463 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 473 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  42.27 
 
 		 438 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  39.66 
 
 		 467 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  39.57 
 
 		 474 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 469 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.52 
 
 		 396 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  38.84 
 
 		 425 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  38.84 
 
 		 425 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 469 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 444 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 443 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 454 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  40.54 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 473 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  39.37 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 476 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 434 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  41.81 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  39.47 
 
 		 499 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 437 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  36.93 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  39.27 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 435 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 446 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 462 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 440 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 455 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  38.25 
 
 		 432 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 455 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 439 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 440 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 455 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 428 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 462 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  38.57 
 
 		 440 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 441 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 428 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 462 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  39.45 
 
 		 443 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04427  two-component system sensor protein  40.28 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 466 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 442 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 428 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 479 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  38.01 
 
 		 440 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 440 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 440 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 428 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 468 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 436 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 493 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  37.9 
 
 		 479 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 484 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 484 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 439 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 460 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 477 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 451 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 468 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 432 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 442 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>