More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0851 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  86.12 
 
 
454 aa  750    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
453 aa  865    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.26 
 
 
469 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  56.7 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.53 
 
 
497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  56.6 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
446 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  43.11 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  48.94 
 
 
458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
493 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  44.4 
 
 
276 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
443 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
464 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  32.11 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
485 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
451 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  34.34 
 
 
440 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  39.65 
 
 
425 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  40.89 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
717 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
443 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
494 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
454 aa  199  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  40.82 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
469 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  41.96 
 
 
391 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
484 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
484 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
535 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
349 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
475 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
484 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
419 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 
330 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  37.02 
 
 
344 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.04 
 
 
396 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  38.79 
 
 
499 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  37.1 
 
 
474 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
435 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
473 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  34.17 
 
 
469 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
435 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
434 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  42.79 
 
 
270 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
451 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  36.33 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  42.8 
 
 
482 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  42.8 
 
 
473 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
463 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  43.45 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
473 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
439 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  35.28 
 
 
480 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
440 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
440 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
488 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  37.37 
 
 
458 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
428 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
428 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  39.79 
 
 
440 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  39.19 
 
 
443 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  33.16 
 
 
440 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
441 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
488 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  40.5 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
454 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
480 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
442 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
428 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
428 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  40.99 
 
 
432 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  39.93 
 
 
448 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
469 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  33.68 
 
 
359 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
476 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  36.97 
 
 
434 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
443 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
440 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
440 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  41.06 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  39.86 
 
 
442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  33.33 
 
 
439 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>