More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5209 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  100 
 
 		 440 aa  885    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  42.57 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  35.08 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3730  histidine kinase  35.24 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  33.22 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  35.79 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 443 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  36.46 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  33.99 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  37.08 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  37.92 
 
 		 491 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 717 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 349 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  31.94 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  34.46 
 
 		 276 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 483 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  33.83 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  35.41 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 344 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 463 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 442 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 451 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 494 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  35.41 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 344 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  34.5 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  28.67 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  31.18 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  34.34 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 484 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  31.7 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 464 aa  146  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  34.91 
 
 		 270 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  34.2 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  30.2 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  30.3 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  28.61 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 440 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 480 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  30.87 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  33.57 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  28.7 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>