More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4348 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
488 aa  1004    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
480 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  44.62 
 
 
482 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  44.27 
 
 
473 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
479 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
484 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
484 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  42.42 
 
 
483 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  40.25 
 
 
480 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
484 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
475 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  42.23 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001060  signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
476 aa  349  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
443 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.67 
 
 
396 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
717 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
535 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  34.81 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
454 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
469 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
441 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  37.32 
 
 
391 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
472 aa  189  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  37.01 
 
 
454 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  36.76 
 
 
276 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
488 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
453 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
494 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
453 aa  186  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
453 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
493 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
330 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
469 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  38.49 
 
 
448 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  28.11 
 
 
474 aa  181  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
488 aa  179  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
488 aa  179  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
463 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
344 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
442 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  38.82 
 
 
438 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  38.08 
 
 
479 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
454 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
462 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
442 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
466 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
451 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
425 aa  170  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
440 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
469 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
462 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  34.62 
 
 
444 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
444 aa  170  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  34.56 
 
 
344 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  36.16 
 
 
458 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
462 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
460 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
440 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
462 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  34.3 
 
 
458 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
440 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
476 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  29.02 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
441 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
437 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  36.78 
 
 
443 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  36.43 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
469 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
464 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
455 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
443 aa  163  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
442 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  33.7 
 
 
425 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  28.2 
 
 
440 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
435 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
419 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  33.7 
 
 
425 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  35.14 
 
 
468 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
472 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  35.14 
 
 
468 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
434 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
428 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
439 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
493 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  35.02 
 
 
467 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>