More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3438 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 419 aa  818    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.57 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3026  histidine kinase  43.38 
 
 		 397 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  38.64 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  34.72 
 
 		 454 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 717 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 535 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  38.52 
 
 		 276 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 493 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  32.31 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 451 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 428 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 441 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  38.29 
 
 		 270 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  30.81 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  32.05 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 473 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  29.24 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  31.37 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 454 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  33.87 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  34.18 
 
 		 473 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  29.6 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  32.01 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 435 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  28.44 
 
 		 446 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  29.79 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  29.72 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 349 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  30.11 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  31.95 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  29.68 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 488 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  30.13 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  34.07 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  31.66 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  29.59 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.13 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  31.37 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  34.48 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  30.43 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  29.36 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  34.88 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>