More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2156 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
473 aa  900    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3026  histidine kinase  53.85 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38166  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  32.39 
 
 
467 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
469 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
454 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.76 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
453 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
472 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
443 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
493 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
488 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  35.82 
 
 
425 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
488 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
425 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
443 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
451 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
494 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
437 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
444 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
442 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  37.35 
 
 
276 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.81 
 
 
474 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
464 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
535 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
485 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
717 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
434 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  38.91 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
451 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
435 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  39.86 
 
 
440 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
441 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
441 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
476 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
456 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
473 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  39.73 
 
 
270 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
442 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
440 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
440 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
480 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
440 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
428 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
444 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
428 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
446 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  35.08 
 
 
435 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
488 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
479 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  33.55 
 
 
425 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
453 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
330 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  35.29 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  37.41 
 
 
442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
428 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  38.91 
 
 
358 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  34.6 
 
 
391 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  36.07 
 
 
458 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
463 aa  161  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  36.8 
 
 
443 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
455 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  42.55 
 
 
491 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.9 
 
 
499 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  42.55 
 
 
486 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
349 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
455 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  36.56 
 
 
479 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
454 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  36.36 
 
 
438 aa  156  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
497 aa  156  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
455 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  37.4 
 
 
434 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
430 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
438 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
468 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
425 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  35.34 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
344 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  37.17 
 
 
435 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  37.13 
 
 
438 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
344 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  34.38 
 
 
522 aa  147  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  37.72 
 
 
447 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  37.72 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  37.72 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  35.15 
 
 
444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  37.72 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  37.72 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
493 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>