More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3730 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3730  histidine kinase  100 
 
 		 458 aa  927    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  41.03 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  35.68 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  38.23 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  35.54 
 
 		 454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 469 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  37.13 
 
 		 276 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  36.76 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 344 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 344 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  31.99 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  35.87 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  34.68 
 
 		 270 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 717 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  34.69 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  36.43 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 488 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 535 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.84 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 488 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 488 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  33.83 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  32.99 
 
 		 499 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 419 aa  143  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  35.25 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  35.25 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 330 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 443 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  29.29 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  32.2 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  33.44 
 
 		 444 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  33.48 
 
 		 440 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  31.67 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  33.72 
 
 		 482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  33.72 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 473 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  31.62 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  31.62 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 428 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  30.29 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>