More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5943 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.11 
 
 
437 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.64 
 
 
437 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.11 
 
 
437 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  100 
 
 
439 aa  880    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  77.63 
 
 
440 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  99.09 
 
 
439 aa  874    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  76.94 
 
 
440 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  78.08 
 
 
437 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.64 
 
 
437 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  78.22 
 
 
438 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  76.99 
 
 
437 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  36.11 
 
 
432 aa  269  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  39.18 
 
 
438 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  40.74 
 
 
446 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  34.75 
 
 
438 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  34.53 
 
 
438 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  34.53 
 
 
438 aa  239  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  38.18 
 
 
440 aa  239  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  38.24 
 
 
436 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  34.53 
 
 
438 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  38.29 
 
 
436 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  34.53 
 
 
438 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  34.38 
 
 
438 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.96 
 
 
444 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  33.78 
 
 
438 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  39.47 
 
 
430 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  34.53 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  37.43 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  37.71 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  33.7 
 
 
450 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  36.95 
 
 
435 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  33.93 
 
 
447 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  33.7 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  33.93 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  33.7 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  33.93 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  33.93 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  33.7 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  33.93 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  33.7 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  33.48 
 
 
450 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  33.93 
 
 
448 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  40.58 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  35.94 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  35.65 
 
 
430 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  36.89 
 
 
438 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.88 
 
 
470 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  32.65 
 
 
450 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  32.65 
 
 
450 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  32.65 
 
 
450 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  32.37 
 
 
452 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
451 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  31.67 
 
 
523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  32.12 
 
 
453 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  31.67 
 
 
522 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
448 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  32.8 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  31.89 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
451 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  45.52 
 
 
471 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
486 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  37.13 
 
 
445 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
439 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  36.16 
 
 
438 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
438 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
438 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
438 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
438 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
438 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
449 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.51 
 
 
437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.51 
 
 
437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.51 
 
 
437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.51 
 
 
437 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46560  periplasmic sensory histidine protein kinase  37.22 
 
 
444 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.744037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.56 
 
 
423 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
433 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  35.52 
 
 
453 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
446 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
437 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
453 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.77 
 
 
453 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  35.51 
 
 
437 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  35.51 
 
 
437 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
430 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
420 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0872586  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3275  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  33.71 
 
 
420 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159412  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
453 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
421 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.74 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
465 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.33 
 
 
454 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
453 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>