More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4811 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  87.69 
 
 		 458 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  83.37 
 
 		 457 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  87.69 
 
 		 458 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  81.62 
 
 		 457 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  83.37 
 
 		 457 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  87.69 
 
 		 458 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  81.4 
 
 		 456 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  81.4 
 
 		 456 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  82.06 
 
 		 456 aa  704    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  83.37 
 
 		 457 aa  720    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  82.68 
 
 		 456 aa  702    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  100 
 
 		 457 aa  924    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  43.42 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  45.77 
 
 		 464 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  44.25 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  45.79 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  44.06 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.96 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  35.27 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  36.4 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  35.43 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.97 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 455 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  35.81 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  36.69 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  34.66 
 
 		 472 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  37.79 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 467 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  39.39 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 455 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.01 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  37.55 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  37.77 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  37.41 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  37.94 
 
 		 480 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  35.06 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  36.92 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  36.69 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  34.08 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  34.08 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  34.08 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  30.9 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 563 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  34.01 
 
 		 381 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  31.4 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.01 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.5 
 
 		 365 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 563 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  32.21 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  32.21 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  33.46 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>