More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0496 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  100 
 
 		 481 aa  966    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 491 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 496 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 496 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 518 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  37.63 
 
 		 517 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  34.24 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 494 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  33.95 
 
 		 511 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 478 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  31.71 
 
 		 477 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  33.4 
 
 		 477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  34.62 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  33.06 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  33.06 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  32.92 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  33.4 
 
 		 482 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  37.5 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  37.5 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  39.48 
 
 		 486 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 640 aa  152  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1010 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 620 aa  150  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.27 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  30.14 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  28.8 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  36.15 
 
 		 617 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  36.4 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  36.4 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 614 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 639 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 568 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 920 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 639 aa  140  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  36.4 
 
 		 461 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.22 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 641 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  31.69 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.87 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 829 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1528  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  31.4 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 1039 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2536  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 829 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  35.78 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 713 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  31.1 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  31.1 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  29.08 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  28.57 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 625 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  30.82 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 708 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  29.72 
 
 		 369 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1046 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.13 
 
 		 1514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.54 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 885 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>