More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1928 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 920 aa  1821    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 682 aa  271  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 408 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 576 aa  194  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 625 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 589 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1158 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  27.81 
 
 		 1353 aa  174  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30 
 
 		 1364 aa  171  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 473 aa  171  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 903 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 		 1374 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.91 
 
 		 1287 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 1010 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 618 aa  164  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.04 
 
 		 823 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 885 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 		 1053 aa  160  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 1046 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1068 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 566 aa  160  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 1007 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 590 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 572 aa  157  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0191  ATPase domain-containing protein  40.38 
 
 		 510 aa  157  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 1711 aa  157  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 453 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  43.53 
 
 		 535 aa  157  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 815 aa  157  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  39.41 
 
 		 617 aa  157  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 1099 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.27 
 
 		 1348 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 596 aa  155  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1363 aa  155  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  39.22 
 
 		 470 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 519 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 371 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  40.47 
 
 		 593 aa  154  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 932 aa  153  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  30.58 
 
 		 576 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 676 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 600 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 917 aa  153  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 911 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  40.43 
 
 		 347 aa  152  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 568 aa  153  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 590 aa  152  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 582 aa  152  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  30.28 
 
 		 810 aa  152  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 607 aa  152  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  29.77 
 
 		 771 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  30.17 
 
 		 772 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  29.77 
 
 		 771 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  29.77 
 
 		 771 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 1431 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 581 aa  152  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 		 882 aa  152  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  29.98 
 
 		 771 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1350 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 458 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.67 
 
 		 1051 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  37.3 
 
 		 352 aa  150  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  35.83 
 
 		 397 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  29.98 
 
 		 771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 737 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 584 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 652 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 		 1119 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  40.08 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 1741 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  30.02 
 
 		 769 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  36.79 
 
 		 551 aa  149  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 640 aa  149  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  37.8 
 
 		 549 aa  149  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 		 765 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 1002 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 423 aa  148  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 569 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 763 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 453 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 412 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1090 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 584 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.04 
 
 		 935 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1090 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  28.46 
 
 		 746 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.68 
 
 		 1535 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  39.04 
 
 		 510 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.56 
 
 		 581 aa  147  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 1153 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  40.43 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  33.33 
 
 		 598 aa  146  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 456 aa  146  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 590 aa  146  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>