More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0610 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 494 aa  996    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  100 
 
 		 494 aa  996    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 639 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 488 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 640 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 614 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.21 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 511 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  38.55 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  37.12 
 
 		 486 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 518 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 639 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 639 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 641 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  25 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  36.99 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  36.99 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  32.67 
 
 		 481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 958 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  36.91 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.06 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 638 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 613 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1352 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 614 aa  136  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  32.62 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  32.19 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 589 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  31.27 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 932 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  31.27 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  31.27 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 595 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.82 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  31.56 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  31.56 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  31.56 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 592 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 784 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 634 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 533 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  30.77 
 
 		 1003 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  31.93 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  29.64 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  29.13 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.39 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  36.21 
 
 		 835 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 473 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.65 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 718 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 856 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 929 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  25.58 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.91 
 
 		 1177 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.91 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 524 aa  127  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.99 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 919 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 1162 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 487 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 568 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  27.2 
 
 		 1127 aa  127  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  31.45 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.484576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>