More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0792 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  100 
 
 		 505 aa  1017    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.6 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  43.43 
 
 		 482 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.03 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.84 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 539 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  32.19 
 
 		 597 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 581 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  38.33 
 
 		 586 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  37.36 
 
 		 608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  38.07 
 
 		 544 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  39.35 
 
 		 557 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  39.83 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  34.95 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  35.16 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 572 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  31.4 
 
 		 567 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  32.06 
 
 		 594 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 575 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  33.19 
 
 		 450 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  36.48 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 547 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 589 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 		 579 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  38.17 
 
 		 594 aa  183  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  33.33 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  31.78 
 
 		 558 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  36.22 
 
 		 648 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  31.02 
 
 		 801 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 554 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 605 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 607 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.96 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.82 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 510 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  30.86 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.94 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 470 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.28 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.37 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 463 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.25 
 
 		 462 aa  153  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  36.88 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.11 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 466 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  35.31 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 466 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 1133 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 723 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.12 
 
 		 461 aa  146  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 613 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  27.68 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 639 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.15 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.14 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.15 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 515 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>