More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1831 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  926    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  43.96 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  43.21 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4038  histidine kinase  42.67 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0685661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0396  histidine kinase  38.73 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 555 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 555 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 581 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  31.49 
 
 		 505 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 575 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 547 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 607 aa  156  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.2 
 
 		 1162 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  33.06 
 
 		 567 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 601 aa  153  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  41.22 
 
 		 347 aa  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  29.96 
 
 		 597 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 577 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 538 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 551 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  35.2 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  35.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  35.53 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  35.87 
 
 		 608 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  38.46 
 
 		 343 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  32.99 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  23.51 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  36.59 
 
 		 557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  34.69 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  36.93 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  36.18 
 
 		 594 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  40.3 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 565 aa  141  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  34.69 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  34.69 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  34.69 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  34.69 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  37.5 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  34.8 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  34.8 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  34.8 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  34.59 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  32.84 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  38.13 
 
 		 360 aa  137  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.09 
 
 		 470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  34.07 
 
 		 457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  33.56 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  30.75 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 524 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.16 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.42 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.71 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  34.93 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 589 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  33.24 
 
 		 594 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  32.19 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  39.69 
 
 		 328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.22 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 515 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.66 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.58 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.95 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 611 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  33.09 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  34.55 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  34.48 
 
 		 587 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  29.94 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 524 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  34.9 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>