More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2814 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 457 aa  875    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.36 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  43.3 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  42.38 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0396  histidine kinase  39.56 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4038  histidine kinase  42.25 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0685661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 575 aa  156  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 601 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  29.78 
 
 		 505 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  30.35 
 
 		 597 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  39.62 
 
 		 566 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 579 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  32.88 
 
 		 557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  30.31 
 
 		 482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.05 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  31.02 
 
 		 544 aa  146  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 607 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  36.48 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  33.33 
 
 		 594 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  33.15 
 
 		 567 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 605 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 577 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  31.44 
 
 		 608 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 555 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 555 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 509 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  35.26 
 
 		 587 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 460 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  31.62 
 
 		 594 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  35.77 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  34.17 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  38.62 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  31.34 
 
 		 648 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 539 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 572 aa  136  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  31.27 
 
 		 558 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.69 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  35.17 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  34.56 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  30.63 
 
 		 801 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.06 
 
 		 486 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 574 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  35.61 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  35.61 
 
 		 542 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  23.72 
 
 		 454 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  30 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  32.01 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  31.11 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 524 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  31.11 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  30.03 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  29.16 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  35.82 
 
 		 483 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 468 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 468 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  34.93 
 
 		 583 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 468 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  34.81 
 
 		 455 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.96 
 
 		 490 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.69 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.18 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.93 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  30.81 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.92 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  31.94 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  30.79 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  36.56 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>