More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3636 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 557 aa  1104    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  65.7 
 
 		 567 aa  654    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.56 
 
 		 555 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.56 
 
 		 555 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.51 
 
 		 547 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.92 
 
 		 552 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.35 
 
 		 551 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.27 
 
 		 554 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  53.89 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  54.81 
 
 		 801 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 605 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  50.46 
 
 		 648 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  50.79 
 
 		 579 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  47.42 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  48.96 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 575 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  50.49 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  41.7 
 
 		 597 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  43.14 
 
 		 608 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  45.3 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  47.67 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  47.16 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.36 
 
 		 579 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  43.98 
 
 		 586 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 601 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 589 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 574 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  45.38 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  52.91 
 
 		 558 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 538 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 565 aa  266  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  35.98 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.84 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.85 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  31.58 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.87 
 
 		 463 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 487 aa  163  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 613 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  35.99 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  35.99 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 496 aa  157  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.65 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  31.27 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 467 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.55 
 
 		 501 aa  150  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 371 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.23 
 
 		 468 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.37 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 639 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  33.23 
 
 		 391 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  30.87 
 
 		 450 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 639 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.28 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.21 
 
 		 906 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.53 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.38 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  35.21 
 
 		 594 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 477 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 631 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 510 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  32.53 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  31.87 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 459 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 608 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  29.04 
 
 		 466 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  28.44 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1145 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 545 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 359 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 458 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.78 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>