More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20811 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 496 aa  1010    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20731  hypothetical protein  91.59 
 
 		 140 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  36.1 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  30.46 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.47 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 524 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  32.07 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 639 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 639 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 639 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 641 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1343  histidine kinase  33.33 
 
 		 713 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0921834  normal  0.552971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  32.09 
 
 		 477 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 469 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 474 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  30.41 
 
 		 431 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  35.19 
 
 		 910 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.24 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 		 839 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 953 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.2 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 359 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  28.04 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  36 
 
 		 539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  33.7 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  28.04 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  28.04 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 469 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  28.04 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.76 
 
 		 446 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  27.48 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  33.03 
 
 		 506 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 441 aa  126  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  33.77 
 
 		 937 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 754 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 614 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 938 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.86 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  28.17 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  27.27 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 896 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1021 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  26.85 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1207 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  31.73 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  34.76 
 
 		 938 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 944 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  27.51 
 
 		 491 aa  124  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  29.94 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 300 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  27.51 
 
 		 491 aa  123  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  27.45 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.66 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 1629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  31.13 
 
 		 566 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  27.17 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  32.4 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  30.09 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 725 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  27.81 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 597 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>