More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0442 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  92.79 
 
 		 611 aa  1102    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.13 
 
 		 599 aa  890    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.22 
 
 		 566 aa  904    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.84 
 
 		 563 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 607 aa  1206    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.25 
 
 		 602 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  78.95 
 
 		 605 aa  926    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.56 
 
 		 581 aa  900    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.83 
 
 		 616 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  59.93 
 
 		 616 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  59.93 
 
 		 616 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.28 
 
 		 601 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.05 
 
 		 611 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.93 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.45 
 
 		 605 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  59.36 
 
 		 605 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.36 
 
 		 597 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  56.82 
 
 		 590 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.41 
 
 		 578 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  55.76 
 
 		 589 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  55.59 
 
 		 601 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.15 
 
 		 596 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  55.81 
 
 		 596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.99 
 
 		 589 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.78 
 
 		 615 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  53.44 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 564 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 574 aa  317  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 559 aa  310  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 572 aa  300  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.79 
 
 		 577 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 550 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  39 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  38.83 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 592 aa  243  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 501 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 489 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 488 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.76 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 467 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  29.13 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.41 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.41 
 
 		 458 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.81 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.92 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.19 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.19 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 614 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 458 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  34.76 
 
 		 257 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 504 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  31.08 
 
 		 343 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 640 aa  123  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  29.77 
 
 		 494 aa  123  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30 
 
 		 496 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  27.35 
 
 		 518 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  31.67 
 
 		 482 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 750 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  31.3 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 613 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.76 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  35 
 
 		 438 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1409  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  26.89 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.19 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  32.07 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.01 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  30.72 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  34.17 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 487 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 571 aa  114  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  28.33 
 
 		 449 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.92 
 
 		 461 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.92 
 
 		 461 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 		 1133 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.92 
 
 		 461 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 593 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  32.31 
 
 		 389 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 614 aa  113  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  29.09 
 
 		 449 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  29.09 
 
 		 449 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>