More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2513 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  100 
 
 
586 aa  1157    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.99 
 
 
589 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  54.11 
 
 
574 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  55.43 
 
 
587 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 
539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 
575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  49.63 
 
 
558 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  44.22 
 
 
597 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 
601 aa  439  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  45.89 
 
 
608 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  46.64 
 
 
544 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  43.98 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
605 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  44.95 
 
 
579 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
607 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  43.33 
 
 
594 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 
581 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
555 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  47.35 
 
 
594 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
555 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
547 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
552 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  44.21 
 
 
554 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
551 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  43.04 
 
 
567 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  46.3 
 
 
557 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  46.31 
 
 
557 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
572 aa  363  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.62 
 
 
579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
577 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
554 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  43.32 
 
 
801 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  42.74 
 
 
648 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
565 aa  318  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
538 aa  318  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  37.86 
 
 
505 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.61 
 
 
460 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
487 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
467 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  34.36 
 
 
364 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  34.36 
 
 
364 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
425 aa  165  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
364 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  35.98 
 
 
482 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
545 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.87 
 
 
463 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.02 
 
 
468 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  34.62 
 
 
356 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.9 
 
 
486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
484 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
503 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
371 aa  153  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
613 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
462 aa  153  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.65 
 
 
501 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.91 
 
 
503 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
463 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
493 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
466 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
504 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
546 aa  151  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  26.22 
 
 
501 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  32.42 
 
 
518 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
450 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
379 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
379 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  35.19 
 
 
492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.55 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.63 
 
 
456 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
455 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  24.23 
 
 
501 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
601 aa  147  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.65 
 
 
470 aa  147  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
455 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
379 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
469 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
463 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.65 
 
 
473 aa  146  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  26.22 
 
 
501 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
463 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
437 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
413 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  24.85 
 
 
617 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  27.78 
 
 
473 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
640 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
389 aa  146  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  34.51 
 
 
520 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.23 
 
 
457 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
462 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  24.63 
 
 
620 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  24.85 
 
 
616 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.31 
 
 
496 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>