More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 574 aa  1138    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.37 
 
 		 589 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  56.42 
 
 		 558 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  54.11 
 
 		 586 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  55.14 
 
 		 587 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 		 601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  46.29 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  47.86 
 
 		 544 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 575 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  45.05 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 581 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  45.44 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 605 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  43.82 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  44.95 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 565 aa  385  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 547 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  45.4 
 
 		 607 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 552 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  44.34 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 572 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  41.75 
 
 		 554 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  42.31 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  45.32 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  44.89 
 
 		 557 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 577 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.78 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 538 aa  346  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  41.74 
 
 		 648 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  42.64 
 
 		 801 aa  341  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.72 
 
 		 554 aa  334  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  38.61 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.04 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  32.59 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.26 
 
 		 468 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  29.7 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.25 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 487 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  34.21 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  34.48 
 
 		 364 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  34.48 
 
 		 364 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  36.05 
 
 		 391 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  28.71 
 
 		 481 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 483 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.41 
 
 		 486 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 364 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 639 aa  156  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.69 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.33 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 359 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  28.05 
 
 		 501 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.07 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 371 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25.52 
 
 		 456 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 639 aa  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 504 aa  153  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 358 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.59 
 
 		 508 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  35.09 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 525 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 310 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 640 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  32.96 
 
 		 487 aa  150  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 		 1133 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 639 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  33.79 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 438 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 463 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 		 1119 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  30.22 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  37.5 
 
 		 566 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 389 aa  147  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  29.15 
 
 		 503 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 641 aa  147  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 459 aa  147  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 469 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>