More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1241 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  100 
 
 		 587 aa  1150    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  55.2 
 
 		 574 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.85 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  54.81 
 
 		 586 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.67 
 
 		 589 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.16 
 
 		 601 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 		 575 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  50.83 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  48.45 
 
 		 597 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  49.02 
 
 		 608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  49.13 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  48.53 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  49.27 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  46.03 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  45.98 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  46.1 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  46.62 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 555 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 555 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  44.79 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  46.17 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.92 
 
 		 579 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  42.24 
 
 		 554 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 538 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  42.29 
 
 		 648 aa  337  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  37.01 
 
 		 505 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.82 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 467 aa  183  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.01 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  34.85 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  32.72 
 
 		 450 aa  164  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  32.67 
 
 		 450 aa  164  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 613 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 484 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.38 
 
 		 463 aa  160  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 483 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 639 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  24.47 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  27.87 
 
 		 502 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  24.62 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 358 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 359 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 466 aa  150  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  27.21 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.11 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.11 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 462 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.51 
 
 		 503 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 639 aa  146  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 639 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 641 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  33.02 
 
 		 391 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 469 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 977 aa  144  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  36.18 
 
 		 477 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 501 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  144  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  35.03 
 
 		 354 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 455 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 501 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 455 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 589 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 457 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.52 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 463 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 463 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.57 
 
 		 456 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  33.02 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  24.26 
 
 		 620 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  27.22 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>