More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0043 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 565 aa  1136    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 574 aa  363  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 539 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 601 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  39.52 
 
 		 558 aa  307  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  35.91 
 
 		 586 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  37.3 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 575 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  39.66 
 
 		 587 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  35.58 
 
 		 554 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  37.97 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  34.76 
 
 		 608 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  36.9 
 
 		 544 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  35.28 
 
 		 579 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  35.76 
 
 		 594 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 		 557 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 552 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  37.6 
 
 		 594 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  35.34 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 538 aa  266  8.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 547 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  33.65 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 551 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.67 
 
 		 579 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  38.01 
 
 		 648 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  40.64 
 
 		 801 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  30.1 
 
 		 505 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.94 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.6 
 
 		 463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.46 
 
 		 455 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.46 
 
 		 455 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  159  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 359 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 467 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.92 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  31 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.69 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 639 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  27.62 
 
 		 473 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 310 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  27.83 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.77 
 
 		 364 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.77 
 
 		 364 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 486 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.31 
 
 		 462 aa  150  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 458 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 358 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 640 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.13 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.04 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 723 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  27.39 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.32 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.73 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.11 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.11 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 438 aa  145  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.11 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 613 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.46 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  28.22 
 
 		 484 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  28.22 
 
 		 484 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34.48 
 
 		 354 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 639 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.97 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>