More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1850 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  100 
 
 
554 aa  1114    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  52.09 
 
 
557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  51.33 
 
 
557 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  46.34 
 
 
557 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 
581 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
547 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 
551 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.07 
 
 
552 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  47.73 
 
 
567 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
555 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
555 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  45.06 
 
 
608 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
575 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
601 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  41.46 
 
 
597 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  47.2 
 
 
544 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  47.08 
 
 
594 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  46.72 
 
 
801 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
577 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
554 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
605 aa  379  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
539 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  45.05 
 
 
579 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.85 
 
 
579 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  45.74 
 
 
648 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  46.02 
 
 
594 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  44.21 
 
 
586 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 
589 aa  342  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  40.86 
 
 
558 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
538 aa  313  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  43.91 
 
 
587 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
572 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
565 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  35.16 
 
 
505 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.29 
 
 
468 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.2 
 
 
460 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
496 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.14 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  34.27 
 
 
482 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
613 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
500 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.89 
 
 
463 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
487 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.88 
 
 
364 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.88 
 
 
364 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
467 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
621 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
371 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  31.79 
 
 
501 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
469 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.75 
 
 
468 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.58 
 
 
469 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.1 
 
 
477 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.44 
 
 
456 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
466 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34.93 
 
 
354 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
493 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25 
 
 
467 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
462 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.31 
 
 
463 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  32.59 
 
 
356 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  33.19 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.67 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.55 
 
 
486 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.41 
 
 
463 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
471 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
468 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.69 
 
 
463 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  34.15 
 
 
594 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
510 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
425 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
1159 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.97 
 
 
466 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
446 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
639 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
723 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.71 
 
 
508 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.98 
 
 
463 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
358 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.49 
 
 
463 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  36.21 
 
 
347 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1816 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
406 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  26.93 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  26.93 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  26.93 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  26.93 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
621 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>