More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1366 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
555 aa  1098    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
555 aa  1098    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.21 
 
 
547 aa  917    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  65.56 
 
 
557 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.28 
 
 
552 aa  1058    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.69 
 
 
551 aa  901    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  82.89 
 
 
567 aa  849    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.69 
 
 
554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  56.26 
 
 
577 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 
581 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  54.51 
 
 
801 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  54.25 
 
 
648 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
605 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
575 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  47.42 
 
 
554 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  48.21 
 
 
579 aa  425  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  47.91 
 
 
594 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  43.45 
 
 
608 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  48.86 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  47.92 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  49.61 
 
 
594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  45.61 
 
 
544 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
539 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  42.19 
 
 
597 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.72 
 
 
579 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
601 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  45.04 
 
 
586 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
574 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
589 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  44.16 
 
 
587 aa  340  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
607 aa  336  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  51.18 
 
 
558 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
538 aa  310  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
572 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
565 aa  279  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.59 
 
 
468 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  30.93 
 
 
505 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.13 
 
 
460 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  32.89 
 
 
482 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.58 
 
 
463 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  35.19 
 
 
364 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  35.19 
 
 
364 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
452 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
364 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
613 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
487 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  34.55 
 
 
501 aa  160  8e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  33.22 
 
 
518 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  32.72 
 
 
450 aa  157  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
639 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
467 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
483 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
639 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
469 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
371 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  33.07 
 
 
450 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
639 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.14 
 
 
503 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
425 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
510 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
473 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.45 
 
 
508 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
500 aa  144  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
524 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
513 aa  143  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
504 aa  143  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.16 
 
 
391 aa  143  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  32.25 
 
 
482 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  32.31 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  32.33 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.9 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  26.87 
 
 
477 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.51 
 
 
496 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.18 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
473 aa  140  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
458 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.06 
 
 
470 aa  140  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
359 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.84 
 
 
463 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
550 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
462 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  33.33 
 
 
340 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
614 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
493 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
463 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.37 
 
 
463 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  35 
 
 
430 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  35.19 
 
 
594 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  35 
 
 
430 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  32.99 
 
 
354 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
536 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
471 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>