More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4038 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4038  histidine kinase  100 
 
 		 451 aa  860    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0685661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0396  histidine kinase  54.32 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  39.69 
 
 		 450 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  40.4 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 457 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  37.12 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 575 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  34.81 
 
 		 544 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 581 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  33.96 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  35.24 
 
 		 490 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.68 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  35.94 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  35.12 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.43 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 377 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 478 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.56 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  36.56 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 538 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  30.67 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 515 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.48 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  33.24 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.69 
 
 		 460 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.79 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  37.08 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.58 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 524 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  24.89 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.94 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  33.43 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.53 
 
 		 508 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  39.29 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.13 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  29.03 
 
 		 466 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.44 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  31.31 
 
 		 597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  27.74 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 577 aa  128  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  32.01 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  29.75 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  32.22 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  32.22 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  32.22 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  33.11 
 
 		 608 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  32.17 
 
 		 379 aa  127  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  34.32 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 545 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  36.36 
 
 		 508 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 600 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 552 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  31.71 
 
 		 472 aa  126  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  34.57 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  31.18 
 
 		 567 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.83 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.98 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.83 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  33.95 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.56 
 
 		 477 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>