More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4999 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  80.38 
 
 
474 aa  768    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  80.59 
 
 
474 aa  768    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 
474 aa  767    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  98.73 
 
 
474 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  72.36 
 
 
474 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  80.17 
 
 
474 aa  766    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 
474 aa  768    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
474 aa  957    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  80.17 
 
 
474 aa  764    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  99.58 
 
 
474 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 
474 aa  768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  80.8 
 
 
474 aa  772    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  80.38 
 
 
474 aa  768    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  99.16 
 
 
474 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  99.58 
 
 
474 aa  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  59.36 
 
 
477 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  59.36 
 
 
477 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  60.43 
 
 
472 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  58.94 
 
 
472 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  48.87 
 
 
481 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  48.02 
 
 
483 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  48.02 
 
 
483 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  48.02 
 
 
483 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  47.6 
 
 
483 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  50.42 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  47.2 
 
 
474 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  47.05 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  45.07 
 
 
472 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  45.07 
 
 
481 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  47.17 
 
 
478 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  45.55 
 
 
474 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  46.54 
 
 
478 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  45.17 
 
 
477 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  42.86 
 
 
481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  43.79 
 
 
486 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
476 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  44.33 
 
 
465 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  42.53 
 
 
483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  39.37 
 
 
475 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  39.15 
 
 
478 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  39.29 
 
 
477 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  38.7 
 
 
486 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  36.12 
 
 
480 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  38.43 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  31.41 
 
 
628 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  39.65 
 
 
239 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.43 
 
 
469 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
582 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.11 
 
 
455 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  23.33 
 
 
456 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.04 
 
 
466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  26.38 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
489 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  26.09 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  26.09 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
354 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
600 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
488 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
458 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
468 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.32 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
369 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  30.42 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
439 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  24.56 
 
 
466 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
449 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  27.78 
 
 
486 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
468 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  33.57 
 
 
456 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
474 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.25 
 
 
397 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  24.32 
 
 
466 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
494 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  29.34 
 
 
381 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  30.69 
 
 
494 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
606 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.63 
 
 
443 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
376 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  22.72 
 
 
463 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  35.43 
 
 
369 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
467 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  22.72 
 
 
463 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  33.17 
 
 
346 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
585 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
509 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  32.34 
 
 
483 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
484 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>