More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1205 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
486 aa  968    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  51.66 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  51.45 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  51.14 
 
 
481 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  51.24 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  51.45 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  51.45 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  46.22 
 
 
473 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  46.01 
 
 
477 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  47.18 
 
 
474 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  46.44 
 
 
478 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  46.03 
 
 
478 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  46.65 
 
 
474 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  45.49 
 
 
472 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  43.55 
 
 
481 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  43.87 
 
 
474 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  43.87 
 
 
474 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  43.87 
 
 
474 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  43.87 
 
 
474 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  44.12 
 
 
474 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  43.91 
 
 
474 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  43.37 
 
 
474 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  43.63 
 
 
474 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  43.37 
 
 
474 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  45.24 
 
 
472 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  43.45 
 
 
474 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  44.86 
 
 
477 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  44.65 
 
 
472 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  44.86 
 
 
477 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  43.79 
 
 
474 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  43.58 
 
 
474 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  43.79 
 
 
474 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  45.05 
 
 
474 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  43.58 
 
 
474 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  43.16 
 
 
474 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  41.39 
 
 
477 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  44.24 
 
 
483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  41.53 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  44.68 
 
 
465 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  38.98 
 
 
478 aa  332  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  38.11 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  37.03 
 
 
475 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
476 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  37.58 
 
 
494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  59.66 
 
 
239 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  29.41 
 
 
628 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.03 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.49 
 
 
458 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  25.83 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.38 
 
 
458 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
458 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
458 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
459 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
457 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  33.47 
 
 
591 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  34.27 
 
 
412 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
470 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
582 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  25.67 
 
 
465 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
815 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  32.63 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
585 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  26.15 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.74 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.15 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  25.54 
 
 
463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
591 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  23.44 
 
 
471 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  34.38 
 
 
499 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  23.56 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  34.55 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25.49 
 
 
456 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  29.84 
 
 
419 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.41 
 
 
463 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
530 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  32.39 
 
 
885 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.49 
 
 
463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.82 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.49 
 
 
463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
611 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  25.81 
 
 
485 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  25.39 
 
 
463 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
407 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>