More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04742 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  59.66 
 
 		 486 aa  245  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  51.52 
 
 		 481 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  49.35 
 
 		 481 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  49.36 
 
 		 483 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  44.44 
 
 		 478 aa  185  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  48.93 
 
 		 483 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  48.93 
 
 		 483 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  48.93 
 
 		 483 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  44.07 
 
 		 474 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  43.53 
 
 		 473 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  41.7 
 
 		 480 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  44.02 
 
 		 477 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  42.74 
 
 		 474 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  41.88 
 
 		 474 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  39.48 
 
 		 475 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  41.05 
 
 		 472 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  41.15 
 
 		 494 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 476 aa  158  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  40.62 
 
 		 472 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  42.15 
 
 		 477 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  37.45 
 
 		 481 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  42.06 
 
 		 474 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  41.53 
 
 		 478 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  40.6 
 
 		 478 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  38.17 
 
 		 477 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  38.17 
 
 		 477 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  41.63 
 
 		 474 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  41.63 
 
 		 474 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  41.63 
 
 		 474 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  38.17 
 
 		 472 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  41.2 
 
 		 474 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  41.2 
 
 		 474 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  41.2 
 
 		 474 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  41.2 
 
 		 474 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  41.2 
 
 		 474 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  39.65 
 
 		 474 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  39.65 
 
 		 474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  39.65 
 
 		 474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  39.65 
 
 		 474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  39.65 
 
 		 474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  39.65 
 
 		 474 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  38.71 
 
 		 483 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  31.28 
 
 		 628 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  35.24 
 
 		 486 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 589 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  38.46 
 
 		 465 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 525 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  33.48 
 
 		 412 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 462 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  29.6 
 
 		 885 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 581 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  28.44 
 
 		 568 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 454 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 585 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 737 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.48 
 
 		 537 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 497 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.04 
 
 		 906 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  32.65 
 
 		 423 aa  98.6  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  32.13 
 
 		 416 aa  98.2  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  26.91 
 
 		 571 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.58 
 
 		 392 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 478 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 454 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 467 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 889 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  31.42 
 
 		 391 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  34.22 
 
 		 895 aa  95.9  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 464 aa  95.5  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  26.91 
 
 		 571 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 582 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 614 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.56 
 
 		 463 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 418 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 912 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 592 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 522 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 454 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 891 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 591 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0074  histidine kinase  29.07 
 
 		 493 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 892 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 587 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 815 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  32.89 
 
 		 530 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 490 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  30.04 
 
 		 393 aa  92.8  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 463 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 458 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 458 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 462 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 530 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 888 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  27.48 
 
 		 587 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  27.48 
 
 		 587 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  33.19 
 
 		 394 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0404  histidine kinase  27.83 
 
 		 466 aa  92  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 444 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 902 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>