More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  100 
 
 
416 aa  810    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  67.95 
 
 
394 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  60.06 
 
 
401 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  59.64 
 
 
392 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  59.64 
 
 
392 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  59.64 
 
 
392 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  58.75 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  54.11 
 
 
397 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  55.29 
 
 
410 aa  345  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  52.89 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  53.47 
 
 
483 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  48.17 
 
 
391 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  57.58 
 
 
465 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  49.32 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  55.67 
 
 
412 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  52.29 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  59.83 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  47.89 
 
 
435 aa  270  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  51.52 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.55 
 
 
397 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  51.63 
 
 
393 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  54.84 
 
 
391 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  53.18 
 
 
377 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  53.26 
 
 
406 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  58.5 
 
 
397 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  58.58 
 
 
425 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  56.61 
 
 
422 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  43.95 
 
 
415 aa  259  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  54.29 
 
 
409 aa  253  7e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  53.12 
 
 
392 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  43.3 
 
 
398 aa  249  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  46.69 
 
 
382 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  43.72 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.32 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  45.29 
 
 
410 aa  239  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  52.99 
 
 
384 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  47.88 
 
 
257 aa  209  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
443 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  49.39 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
581 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
582 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  42.45 
 
 
599 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
592 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 
589 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
584 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  41.25 
 
 
584 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
584 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  40.08 
 
 
437 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
484 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
458 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
489 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  46.15 
 
 
537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.96 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  31.72 
 
 
565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  40.24 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  40.32 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  40.24 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
585 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
418 aa  173  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
437 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.84 
 
 
436 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  39.84 
 
 
436 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
581 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
442 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
430 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
585 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
442 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  43.57 
 
 
581 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  37.01 
 
 
444 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
585 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
377 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
608 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
587 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
591 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
429 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
439 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
439 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.59 
 
 
575 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
439 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  39.57 
 
 
554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.71 
 
 
587 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  41.92 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.12 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.12 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.82 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  38.62 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.12 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.12 
 
 
587 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
453 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
587 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.82 
 
 
587 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  42.24 
 
 
352 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
612 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>